Quả cà chua có nhiều khoang riêng biệt và ở độ quá lạnh hay quá nóng sẽ làm thành khoang cà chua bị bở khiến quả cà chua bị mềm, vỏ bị nhăn nheo. Hương vị trái cây tươi thơm cũng bị biến thoái làm cho quả cà chua trở nên vô vị, mất đi chất kháng độc tố (antioxidant benefits).
Bạn cần để cà chua trên quầy nhà bếp, từng lớp một nơi thoáng khí nhưng tránh ánh nắng. Muốn cà chua mau chín, bạn để cà chua trong túi giấy với trái táo. Hơi ethylene từ trái táo phát ra là chất xúc tác làm cà chua chín nhanh. Khi cà chua chín, bạn có thể giữ được từ 3 đến 5 ngày tùy theo loại cà chua (plum, romaine, …). Riêng với loại cà chua nhỏ như quả nho hay cherry, bạn có thể giữ cà chua lại trong giá đựng có lỗ khi mua từ chợ.