Sáng ngày 8/9/2016, chùa Liên Trì tọa lạc tại Thủ Thiêm đã bị nhà cầm quyền CSVN dùng vũ lực để cưỡng chế. Chính quyền đã điều động đến đây một lực lượng cảnh sát, công an, mật vụ hùng hậu để bắt cóc một loạt sư sãi, phật tử trong chùa đi nơi khác. Cùng với đó, chính quyền đã cho người vào chùa đập phá.
Trong khi đó, rất nhiều giới đấu tranh dân chủ tại Sài Gòn cho biết họ không thể ra khỏi nhà do bị công an, mật vụ ngăn cản. Trong đó, chị Bùi Thị Minh Hạnh còn bị công an kéo xe té trên đường.
Về phía trụ trì chùa Liên Trì, thầy Thích Không Tánh cho biết, sáng ngày 8/9, lực lượng cưỡng chế xông vào chùa và đọc lệnh cưỡng chế. Do vì quá mệt mỏi nên sư thầy đã xỉu xuống. Những người thuộc lực lượng cưỡng chế đã đưa thầy vô bệnh viện để vô nước biển.
Chùa Liên Trì là một trong những cở sở của Giáo Hội Phật giáo Việt Nam Thống Nhất tồn tại từ trước năm 1975 còn sót lại. Sau năm 1981, đại đa phần cơ sở tôn giáo của Giáo hội Phật giáo Việt Nam Thống Nhất đều bị chính quyền giao cho Giáo Hội Phật giáo Việt Nam, trực thuộc Ủy ban Tôn giáo của Mặt trận Tổ quốc Việt Nam quản lý.